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然而更多的内丹家，更强调性命这对概念中所包涵的先天生命本体性与神秘性。
他们认为，所谓“性”不仅仅是一般的精神意识，而是人先天所有的遗传性思维物质和精神本体；
亦即所谓的“元神”或“真性”；
而“命”所意指的也不只是人的身体，甚至也不仅指人体内部一般营卫呼吸之气，而是指人与生俱来的元或先天祖烈。
元代内丹家李道纯指出：“夫性者先天至神一灵之谓也，命者先天至精一气之谓也。
”4明代内丹家伍冲虚说：“性即元神，命即元，是我生身本来之所自有者。”
中国气功学和医学生理学关于元气的论述出现较早，早在《内经》中就有所叙述。
但元神或真性的学说却相对较晚，并且主要是借鉴于佛教，尤其是禅宗。
中国大乘佛教的“真如缘起论”认为：众生皆具有大智慧光明的、遍照世界的、真实识知的“真心”、“真如本性”，亦称“法性”或“佛性”。
《华严经》说：“法性如虚空，诸佛于中住。”